Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SGCAQ16586 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SGCAQ16586 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SGCAQ16586 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SGCAQ16586 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SGCAQ16586 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SGCAQ16586 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SGCAQ16586 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SGCAQ16586 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SGCAQ16586 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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