Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRY1Q16526 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRY1Q16526 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRY1Q16526 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CRY1Q16526 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CRY1Q16526 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CRY1Q16526 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRY1Q16526 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRY1Q16526 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CRY1Q16526 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRY1Q16526 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRY1Q16526 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRY1Q16526 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CRY1Q16526 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRY1Q16526 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CRY1Q16526 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRY1Q16526 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CRY1Q16526 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CRY1Q16526 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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CRY1Q16526 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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CRY1Q16526 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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CRY1Q16526 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CRY1Q16526 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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