Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK4Q16099 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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