Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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ZFHX3Q15911 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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ZFHX3Q15911 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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ZFHX3Q15911 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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ZFHX3Q15911 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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ZFHX3Q15911 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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ZFHX3Q15911 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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ZFHX3Q15911 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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ZFHX3Q15911 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZFHX3Q15911 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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ZFHX3Q15911 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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ZFHX3Q15911 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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ZFHX3Q15911 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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