Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
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TRIP13Q15645 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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