Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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