Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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PTPRRQ15256 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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PTPRRQ15256 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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PTPRRQ15256 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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PTPRRQ15256 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRRQ15256 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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