Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCOLCEQ15113 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCOLCEQ15113 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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