Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNC3Q14003 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms