Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DDX39BQ13838 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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