Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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ITGA9Q13797 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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ITGA9Q13797 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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ITGA9Q13797 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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ITGA9Q13797 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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ITGA9Q13797 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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ITGA9Q13797 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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ITGA9Q13797 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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ITGA9Q13797 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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ITGA9Q13797 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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ITGA9Q13797 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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ITGA9Q13797 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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ITGA9Q13797 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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ITGA9Q13797 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGA9Q13797 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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