Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MTMR3Q13615 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms