Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms