Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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