Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCGB2A2Q13296 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms