Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM28Q13263 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM28Q13263 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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