Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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GPS1Q13098 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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GPS1Q13098 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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GPS1Q13098 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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GPS1Q13098 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GPS1Q13098 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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