Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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MRPL28Q13084 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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MRPL28Q13084 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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MRPL28Q13084 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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MRPL28Q13084 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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MRPL28Q13084 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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MRPL28Q13084 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MRPL28Q13084 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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