Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
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