Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFEMP1Q12805 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EFEMP1Q12805 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFEMP1Q12805 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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