Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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RASGEF1BQ0VAM2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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RASGEF1BQ0VAM2 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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RASGEF1BQ0VAM2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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RASGEF1BQ0VAM2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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RASGEF1BQ0VAM2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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RASGEF1BQ0VAM2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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