Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SYCNQ0VAF6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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