Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FMODQ06828 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FMODQ06828 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FMODQ06828 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FMODQ06828 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FMODQ06828 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FMODQ06828 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FMODQ06828 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FMODQ06828 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FMODQ06828 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FMODQ06828 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FMODQ06828 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FMODQ06828 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FMODQ06828 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FMODQ06828 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FMODQ06828 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FMODQ06828 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FMODQ06828 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FMODQ06828 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FMODQ06828 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FMODQ06828 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FMODQ06828 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FMODQ06828 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FMODQ06828 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FMODQ06828 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FMODQ06828 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FMODQ06828 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FMODQ06828 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FMODQ06828 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FMODQ06828 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FMODQ06828 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FMODQ06828 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FMODQ06828 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FMODQ06828 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FMODQ06828 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FMODQ06828 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
FMODQ06828 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
FMODQ06828 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FMODQ06828 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FMODQ06828 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FMODQ06828 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FMODQ06828 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FMODQ06828 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FMODQ06828 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FMODQ06828 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FMODQ06828 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FMODQ06828 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FMODQ06828 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FMODQ06828 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FMODQ06828 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FMODQ06828 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FMODQ06828 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FMODQ06828 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FMODQ06828 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FMODQ06828 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FMODQ06828 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FMODQ06828 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FMODQ06828 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms