Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms