Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms