Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms