Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VLDLRP98155 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms