Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2BP67870 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2BP67870 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2BP67870 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2BP67870 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2BP67870 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2BP67870 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2BP67870 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2BP67870 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2BP67870 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2BP67870 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2BP67870 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2BP67870 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2BP67870 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2BP67870 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2BP67870 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2BP67870 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2BP67870 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2BP67870 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2BP67870 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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