Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RPS29P62273 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
RPS29P62273 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
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