Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO4P61968 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LMO4P61968 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LMO4P61968 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms