Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPZ1P61923 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms