Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms