Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LINC00313P59037 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms