Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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GFRA1P56159 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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GFRA1P56159 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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GFRA1P56159 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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GFRA1P56159 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GFRA1P56159 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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