Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms