Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms