Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMSP52788 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMSP52788 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMSP52788 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMSP52788 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMSP52788 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMSP52788 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMSP52788 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMSP52788 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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