Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPIAP49247 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPIAP49247 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPIAP49247 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPIAP49247 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPIAP49247 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPIAP49247 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPIAP49247 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPIAP49247 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPIAP49247 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPIAP49247 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPIAP49247 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPIAP49247 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPIAP49247 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms