Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTDSS1P48651 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms