Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RANGAP1P46060 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RANGAP1P46060 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms