Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRATP43155 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRATP43155 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRATP43155 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms