Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIA2P42262 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms