Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARL1P40616 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARL1P40616 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARL1P40616 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARL1P40616 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL1P40616 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL1P40616 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL1P40616 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL1P40616 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL1P40616 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL1P40616 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL1P40616 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL1P40616 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL1P40616 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL1P40616 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL1P40616 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL1P40616 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL1P40616 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL1P40616 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL1P40616 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL1P40616 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL1P40616 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL1P40616 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL1P40616 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL1P40616 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL1P40616 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL1P40616 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL1P40616 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL1P40616 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL1P40616 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL1P40616 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL1P40616 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL1P40616 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL1P40616 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL1P40616 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL1P40616 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL1P40616 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL1P40616 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL1P40616 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL1P40616 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL1P40616 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL1P40616 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL1P40616 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARL1P40616 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARL1P40616 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARL1P40616 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARL1P40616 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARL1P40616 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARL1P40616 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARL1P40616 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARL1P40616 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms