Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGM1P36871 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGM1P36871 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGM1P36871 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGM1P36871 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGM1P36871 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PGM1P36871 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PGM1P36871 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGM1P36871 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGM1P36871 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGM1P36871 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGM1P36871 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGM1P36871 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PGM1P36871 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGM1P36871 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGM1P36871 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGM1P36871 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PGM1P36871 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGM1P36871 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGM1P36871 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGM1P36871 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGM1P36871 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGM1P36871 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGM1P36871 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGM1P36871 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGM1P36871 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PGM1P36871 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGM1P36871 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGM1P36871 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGM1P36871 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGM1P36871 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGM1P36871 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGM1P36871 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGM1P36871 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGM1P36871 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGM1P36871 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGM1P36871 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGM1P36871 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PGM1P36871 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGM1P36871 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PGM1P36871 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGM1P36871 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PGM1P36871 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGM1P36871 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGM1P36871 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGM1P36871 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGM1P36871 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGM1P36871 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGM1P36871 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGM1P36871 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGM1P36871 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PGM1P36871 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms