Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRB3P28472 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRB3P28472 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRB3P28472 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRB3P28472 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRB3P28472 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRB3P28472 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRB3P28472 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRB3P28472 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRB3P28472 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRB3P28472 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRB3P28472 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRB3P28472 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms