Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD10P28358 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXD10P28358 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms