Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX2P28328 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX2P28328 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms