Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSMB4P28070 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB4P28070 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms