Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRBP23467 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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