Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF1P22415 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF1P22415 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF1P22415 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF1P22415 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF1P22415 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF1P22415 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF1P22415 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF1P22415 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF1P22415 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF1P22415 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF1P22415 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF1P22415 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
USF1P22415 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF1P22415 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF1P22415 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF1P22415 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF1P22415 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF1P22415 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF1P22415 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USF1P22415 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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